A.农田有效灌溉面积
B.农田灌溉水有效利用系数
C.农业科技进步贡献率
D.农作物耕种收综合机械化率
E.养殖废弃物综合利用率
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A、C、D
根据《全国农业现代化规划（2016~2020年）》，技术装备水平的指标有：农田有效灌溉面积、农业科技进步贡献率和农作物耕种收综合机械化率。选项B农田灌溉水有效利用系数和选项E养殖废弃物综合利用率属于可持续发展指标。